El CMA tiene un funcionamiento basado en el sistema asambleario y regulado por su Reglamento Interno (pdf 64 KB). Entre Asambleas, la representación de los anilladores la ostenta la Comisión de Anilladores y el Director del CMA, elegidos cada dos años por la Asamblea.

El Reglamento Interno y diversas normativas fijan las directrices y capacitación necesarias para que los anilladores actúen de manera rigurosa y efectiva, atendiendo a la legalidad vigente en materia de anillamiento científico de aves, al tiempo que facilitan y mejoran el funcionamiento del CMA. Los anilladores tienen que superar un estricto período de formación antes de que sean considerados capaces de anillar en solitario.

Mediante el Boletín Circular del CMA los anilladores pueden conocer las últimas novedades del CMA y del anillamiento en España. Además, el foro "AnilladoreS" permite mantener en contacto a todos los anilladores que dispongan de correo electrónico.

Finalmente, en la Revista de Anillamiento los anilladores pueden publicar los resultados de sus trabajos y conocer las nuevas técnicas de identificación, datado y sexado de las aves en mano.

Con motivo del 50 Aniversario del Centro de Migración de Aves, celebrado en el año 2007, en La Garcilla n.º 133 contiene un Monográfico especial sobre el anillamiento científico de aves y en CMA.

Director del CMA:

• Juan S. Monrós González. Carcaixent (Valencia). Coordinador del Grupo Pit-roig.

Comisión de Anilladores: 

• Joan Castany i Alvaro. Castellón. Castellón de la Plana. Coordinador de Au.
• Francisco Javier García y Gans. Torrent (Valencia). Coordinador de Albufera.
• José Luis Greño Ruiz. Valencia. Grupo Pit-Roig.
• Miguel Ángel Letón Fernández. Alcalá de Henares (Madrid). Coordinador de Aegithalos.
• Alfredo H. Ortega Morejón. Manzanares El Real (Madrid). Coordinador de Alula.
• Carlos Palanca Maresca. Almería. Coordinador de Rodopechys.
• Rubén Piculo Mateo. Puerto de Sagunto (Valencia). Grupo Pit-Roig.
• Carlos Ponce Cabas. Villaviciosa de Odón (Madrid). Grupo Monticola.
• Sergio Sanz González. Azuqueca de Henares (Guadalajara). Grupo Alula.
• Miguel Tirado Bernat. Benicàssim (Castellón). Grupo Au.
• Juan Antonio Tornero Collado. Alfauir (Valencia). Grupo Albufera.